NEW
Font size
WorksheetsTái tổ hợp tương đồng (Homologous Recombination) - Phần 1
Total questions: 70
Worksheet time: 35mins
Cơ chế tái tổ hợp tương đồng (Homologous Recombination) là quá trình sắp xếp lại trình tự DNA giữa các phân tử DNA có đặc điểm gì?
Có vị trí chuyên biệt cho enzyme recombinase
Có vùng trình tự tương đồng (giống nhau)
Không có gen mã hóa enzyme chuyển vị
Chỉ xảy ra ở sinh vật nhân sơ
Tái tổ hợp tương đồng có thể xảy ra giữa cặp DNA nào sau đây?
DNA của virus và Plasmid
2 DNA của cặp NST tương đồng
DNA mang trình tự lặp lại IR và gen transposase
2 DNA không có vùng tương đồng
Tái tổ hợp tương đồng góp phần vào tính biến động (đa dạng) của vật liệu di truyền bằng cách nào?
Khôi phục chiều dài telomere
Sắp xếp lại các vùng trình tự DNA
Gây ra lỗi bắt cặp tautomer
Loại bỏ các gốc oxy hóa tự do
Ngoài việc tạo tính biến động, tái tổ hợp tương đồng còn có ý nghĩa gì đối với tế bào?
Tham gia sửa sai cho đứt gãy mạch đơn (SSB) và đứt gãy mạch đôi (DSB)
Loại bỏ mồi RNA trên mạch chậm
Kiểm soát các chốt kiểm soát chu kỳ tế bào
Ngăn chặn sự dimer hóa thymine
Mô hình Holliday được đề xuất lần đầu bởi Robin Holliday vào năm nào?
1983
1953
1964
1995
Mô hình Holliday SSB (Single-Strand Break) khởi đầu bằng sự kiện gì trên phân tử DNA?
Gãy cả hai mạch DNA
Hình thành vùng lặp lại IR
Đứt/gãy trên mạch đơn
Mất nhóm methyl bất thường
Sau khi xảy ra đứt gãy mạch đơn (SSB), enzyme loại bỏ nucleotide tạo ra cấu trúc gì có đầu 3' tự do?
Vị trí AP site
Dạng vòng xoay
Vùng ssDNA (sợi đơn DNA)
Cấu trúc D-loop
Đầu 3' của ssDNA được tạo ra trong mô hình Holliday SSB thực hiện hành động gì?
Bị cắt bởi RuvC
Liên kết với Tus/Ter
Xâm lấn mạch lên DNA kề cận
Bị methyl hóa
Sự xâm lấn mạch trong mô hình Holliday SSB tạo ra cấu trúc đặc trưng nào?
Mô hình Trombone
Vị trí oriC
Mối nối Holliday (Holliday Junction, HJ)
Cấu trúc T-loop
Holliday Junction (HJ) là điểm đặc trưng của cơ chế nào?
Sửa sai trực tiếp
Sao chép DNA
Tái tổ hợp tương đồng
Chuyển vị không tạo bản sao
Trong mô hình Holliday, sự xâm lấn mạch dẫn thành hình thành vùng nào, nơi hai DNA có trình tự tương đồng nhưng không hoàn toàn giống nhau?
Noncross over region
Vùng tương đồng dị phân tử (heteroduplex)
Vùng Telomere
Vùng Crossover region
Có bao nhiêu kiểu cắt-nối tại một Holliday Junction (HJ) có thể tạo ra các sản phẩm tái tổ hợp khác nhau?
Một kiểu
Hai kiểu (ngang và dọc)
Ba kiểu
Bốn kiểu
Kiểu cắt-nối tại Holliday Junction theo chiều ngang tạo ra sản phẩm DNA có đặc điểm gì?
DNA có tái tổ hợp (crossover)
DNA bị đứt gãy mạch đôi
DNA không có tái tổ hợp (noncrossover recombinants)
DNA mạch đơn
Kiểu cắt-nối tại Holliday Junction theo chiều dọc tạo ra sản phẩm
DNA không có tái tổ hợp
DNA có tái tổ hợp (crossover recombinants)
DNA bị mất base purine
Vùng DNA mạch thẳng
Mô hình Holliday DSB (Double-Strand Break) được đề xuất bởi ai vào năm 1983, dựa trên nghiên cứu ở S. cerevisiae?
Robin Holliday
James Watson
Jack Szostak
Frederick Griffith
Mô hình Holliday DSB khởi đầu bằng sự kiện gì trên phân tử DNA?
Đứt một mạch DNA
Mất base purine
Đứt/gãy mạch đôi (trên cả hai mạch)
Chuyển vị của transposon
Mô hình Holliday DSB khác với mô hình SSB ở điểm nào về cấu trúc trung gian?
Không hình thành Holliday Junction
Chỉ tạo một vùng heteroduplex
Hình thành đồng thời hai Holliday Junction
Chỉ áp dụng cho DNA vòng
Trong mô hình DSB, sự đứt nối xảy ra trên bao nhiêu phân tử DNA tương đồng?
Ba phân tử DNA
Hai phân tử DNA
Một trong hai phân tử DNA tương đồng
Chỉ trên DNA không tương đồng
Mô hình DSB có sự hình thành đồng thời hai 'cầu' trao đổi chéo trên hai mạch đơn của các đoạn NST tương đồng, sau đó bị cắt bởi enzyme nào?
DNA polymerase I
Helicase DnaB
Endonuclease
Topoisomerase IV
Tái tổ hợp tương đồng ở E.coli chủ yếu diễn ra theo con đường nào?
DSB pathway
MMR pathway
RecBCD pathway
NER pathway
Phức hợp RecBCD trong E.coli có những hoạt tính enzyme nào?
Polymerase, Ligase, Primase
Exonuclease, Endonuclease, Ligase
Nuclease, Helicase, ATPase
Photolyase, Alkyltransferase, Catalase
RecBCD cắt dsDNA và xử lý mạch tạo ssDNA có đầu 3' tự do từ vị trí trình tự đặc hiệu nào?
oriC
Ter sites
Trình tự chi (chi)/chi sequence
Trình tự lặp lại TTAGGG
Protein nào trong E.coli bám lên ssDNA và xúc tác sự xâm lấn ssDNA lên phân tử DNA gắn đôi?
RuvC
RecBCD
RuvA-RuvB
RecA
Phức hợp protein nào nhận diện mối nối Holliday (HJ) và xúc tác sự xâm lấn mạch (branch migration)?
RecBCD
RecA
RuvA - RuvB (ATPase)
RuvC
Sự xâm lấn mạch (branch migration) tạo ra cấu trúc gì trong quá trình tái tổ hợp tương đồng ở E.coli?
Đơn vị sao chép duy nhất
Mô hình Trombome
Vùng dị phân tử mạch đôi (heteroduplex)
Dimer thymine
Enzyme nào chịu trách nhiệm cắt Holliday Junction (HJ) trong cơ chế tái tổ hợp tương đồng RecBCD?
Ligase
DnaB
RecA
RuvC (endonuclease/resolvase)
RecBCD là tổ hợp enzyme, gồm ba tiểu đơn vị nào?
RecA, RecB, RecC
RecB, RecC, RecD
RuvA, RuvB, RuvC
DnaA, DnaB, DnaC
Tiểu đơn vị nào của RecBCD có chức năng nuclease (đa nuclease)?
RecC
RecD
RecB
RecA
Tiểu đơn vị nào của RecBCD chịu trách nhiệm nhận biết vị trí đặc hiệu KAI (/CHI site)?
RecB
RecD
RecC
RuvB
Sự di chuyển của tổ hợp enzyme RecBCD trên DNA được hỗ trợ bởi hoạt tính nào?
Hoạt tính primase
Hoạt tính ligase
Thủy phân ATP trong các 'động cơ' helicase của RecB và RecD
Hoạt tính quang phục hồi
Cấu trúc trung gian nào được tạo ra bởi RecBCD, gồm sợi đơn DNA có hai đầu 3' ngắn và 5' dài hơn?
Cấu trúc T-loop
Cấu trúc Holliday Junction
Cấu trúc vòng hai đuôi (loop 2 tail)
Cấu trúc oriC
Sau khi RecBCD trượt đến vị trí KAI, tiểu đơn vị nào sẽ nhận biết và truyền tín hiệu?
RecB
RecC
RecD
RecA
RecBCD xúc tác việc tải phân tử protein nào lên đoạn sợi đơn DNA có vị trí KAI?
RuvC
DnaA
Pol I
RecA
RecBCD là cơ chế tái tổ hợp tương đồng sử dụng phương thức nào để khởi đầu quá trình?
SSB (Single-strand breaks)
MMR (Mismatch repair)
DSB (Double-strand breaks)
Photoreactivation
Tái tổ hợp tương đồng có thể xảy ra giữa 2 vùng tương đồng trên cùng một phân tử DNA không?
Không, chỉ xảy ra giữa các phần tử DNA khác nhau
Không, chỉ giữa các NST tương đồng
Có
Chỉ giữa DNA vòng
Ý nghĩa của tái tổ hợp tương đồng trong việc sửa sai là gì?
Chỉ sửa lỗi bắt cặp sai
Có thể sửa lỗi (sửa hoàn toàn) hoặc sửa cho qua (sửa không hoàn toàn)
Chỉ loại bỏ dimer thymine
Chỉ loại bỏ nhóm methyl bất thường
Tiểu đơn vị RecC của RecBCD có chứa miền đặc trưng nào của SF1?
Miền ATPase
Miền Nuclease
Miền helicase (Miền 1 và 2)
Miền 5' -> 3' polymerase
Quá trình trao đổi chéo (crossover) hoặc không trao đổi chéo (noncrossover) là kết quả của việc xử lý cấu trúc nào?
Vị trí AP site
Trình tự lặp lại TTAGGG
Ngã tư Holliday (Holliday Junction)
Plasmid F
Tiểu đơn vị RecB của RecBCD có chức năng helicase đặc trưng cho loại nào?
SF2
SF3
SF1
SF4
Quá trình tái tổ hợp tương đồng trong E.coli được cho là có sự tham gia của ít nhất bao nhiêu protein khác?
Khoảng 5
Khoảng 10
Ít nhất 25
Hàng trăm
Tái tổ hợp chuyên biệt vị trí là quá trình sắp xếp lại DNA giữa các phần tử có đặc điểm gì?
Có vùng trình tự tương đồng lớn
Có vị trí chuyên biệt cho các enzyme site-specific recombinases (SSRs)
Chỉ xảy ra ở tế bào mầm
Phải thông qua trung gian RNA
Tái tổ hợp chuyên biệt vị trí được chia thành mấy nhóm chính?
Một nhóm
Hai nhóm (Bảo tồn và Chuyển vị)
Ba nhóm
Bốn nhóm
Enzyme chịu trách nhiệm cho phương thức tái tổ hợp chuyên biệt vị trí bảo tồn là gì?
RecBCD
DnaA
Tyrosine/Serine Recombinases
DNA pol
Các DNA tái tổ hợp chuyên biệt vị trí phải chứa trình tự nhận biết chuyên biệt nào?
oriC sequence
Recombination Site (RS)
TTAGGG repeats
Telomere repeats
Cấu trúc Recombination Site (RS) bao gồm thành phần nào?
Gen transposase + Vùng mã
Trình tự nhận biết/gắn (recognition sequences) + trình tự cắt-nối chéo (crossover region)
Telomere + T-loop
DnaB + DnaC
Phương thức tái tổ hợp chuyên biệt vị trí nào thực hiện cắt và tái tổ hợp từng mạch đơn của DNA?
Tái tổ hợp bởi Serine Recombinase
Tái tổ hợp bởi Tyrosine Recombinase
Tái tổ hợp DSB tương đồng
Chuyển vị tạo bản sao
Phương thức tái tổ hợp chuyên biệt vị trí nào thực hiện cắt mạch đôi và tái tổ hợp?
Tái tổ hợp bởi Tyrosine Recombinase
Tái tổ hợp bởi Serine Recombinase
Cơ chế quang phục hồi
Cơ chế MMR
Tái tổ hợp chuyên biệt vị trí theo phương thức chuyển vị còn được gọi là gì?
Sửa sai gián tiếp
Sao chép vòng xoay
Transposition (Di chuyển vị trí)
Proofreading
Ý nghĩa chính của tái tổ hợp chuyên biệt vị trí trong tế bào là gì?
Phục hồi telomere
Tạo tính biến động (đa dạng cấu trúc/thông tin)
Loại bỏ mồi RNA
Gỡ rối DNA (Decatenation)
Trình tự có khả năng di chuyển trong quá trình Transposition được gọi là gì?
Plasmid F
OriC
Yếu tố chuyển vị / "gen nhảy" (TTCV)
Heteroduplex
Yếu tố chuyển vị (TTCV) thường được chia thành mấy loại dựa vào cấu trúc cơ bản?
Hai loại (TTCV chủ động/bị động)
Ba loại (IS, Transposon, Non-composite transposon)
Bốn loại (Tyrosine, Serine, RecA, RuvC)
Một loại (Retrotransposon)
Cấu trúc Insertion Sequence (IS) bao gồm thành phần nào?
Gen kháng kháng sinh + IR
IR + Gen Transposase + IR
OriC + Ter sites
Gen bị đột biến mất đoạn
Cấu trúc Transposon (Tn) bao gồm thành phần nào?
IR + Gen Transposase + IR
IS(L) + Gen kháng kháng sinh + IS(R)
Cấu trúc vòng xoay
DNA mạch thẳng
Yếu tố Ac (Activator) có khả năng tự di chuyển trong hệ gen vì nó có gì?
Trình tự lặp lại IR
Gen mã hóa enzyme transposase
Gen kháng kháng sinh
Dạng tautomer
Yếu tố Ds (Dissociation) được xem là trình tự chuyển vị bị động vì lý do gì?
Cần ánh sáng để hoạt động
Gen mã hóa transposase bị đột biến mất đoạn
Chỉ có hoạt tính 3'->5' exonuclease
Chuyển vị qua trung gian RNA
Ds chỉ có thể chuyển vị khi có mặt yếu tố nào?
Telomerase
RecA
Ac (Activator)
RuvC
Hiện tượng hạt ngô có màu sắc loang lổ (variegation) là do yếu tố nào?
DNA polymerase
DNA Ligase
Các yếu tố chuyển vị (ví dụ Ac/Ds)
Enzyme SOD
Trong chuyển vị không tạo bản sao, số lượng bản sao của transposon trong tế bào sau sự kiện chuyển vị thay đổi như thế nào?
Số lượng tăng lên
Số lượng không tăng lên (giữ nguyên)
Số lượng giảm đi
Transposon bị chuyển thành DNA vòng
Trong cơ chế chuyển vị không tạo bản sao (cắt và chèn), enzyme nào nhận biết, cắt transposon khỏi vị trí cũ và chèn vào vị trí mới?
Primase
Ligase
Transposase
Telomerase
Trong chuyển vị không tạo bản sao, phức hợp nào uốn hai đầu transposon lại để chuẩn bị cho bước cắt?
Holliday Junction
Synaptic complex
RecBCD complex
Replisome
Chuyển vị tạo bản sao qua trung gian RNA cần enzyme nào để tổng hợp DNA từ khuôn RNA?
RNA Polymerase
DNA Polymerase
Primase
Reverse Transcriptase (RTase)
Retrotransposon cần enzyme nào để tạo ssDNA (cDNA) từ mạch khuôn RNA-L1?
RNA mới
DNA vòng
RNA-L1
Cấu trúc T-loop
Trong chuyển vị tạo bản sao qua sao chép DNA, cấu trúc nào hình thành do enzyme chuyển vị nối đầu mạch tự do của transposon vào vị trí mới?
Cấu trúc “dung hợp” DNA (cointegrate)
Synaptic complex
Heteroduplex
AP site
Tái tổ hợp chuyên biệt vị trí theo phương thức bảo tồn được phân loại thành Tyrosine và Serine recombinases dựa trên yếu tố nào?
Kích thước DNA được xử lý
Cấu trúc của RS
Loại enzyme tham gia (Tyrosine/Serine recombinases)
Phân loại tế bào (Proka/Euka)
Quá trình chuyển vị không tạo bản sao được mô tả bằng ví dụ transposon nào ở ngô, nơi yếu tố này bị cắt ra khỏi vị trí cũ và chèn vào vị trí mới?
Ds
Ac
Telomerase
Plasmid F
Khi transposon Ac bị cắt ra khỏi gen Wx (ở ngô), trình tự DNA tại vị trí cũ có hoàn toàn trở lại như ban đầu không?
Có, hoàn toàn như cũ
Không, có thể để lại dấu lặp không hoàn hảo (imperfect duplication)
Chỉ thay đổi khung đọc
Trình tự bị alkyl hóa
Trong chuyển vị tạo bản sao (qua sao chép DNA), hoạt tính endonuclease của enzyme chuyển vị xúc tác bước nào?
Tổng hợp đoạn mồi RNA
Xúc tác xâm lấn mạch
Cắt 1 mạch DNA tại 2 đầu của transposon và tại vị trí chuyển vị đến
Loại bỏ dimer thymine
Phức hợp RecBCD trong E.coli có vai trò gì nổi bật?
Gây tái tổ hợp tương đồng ở vi khuẩn
Tổng hợp DNA bộ gen
Sửa lỗi mismatch
Khử amin của Cytosine
Sự khác biệt về cấu trúc giữa IS (Insertion Sequence) và Transposon (Tn) là gì?
IS có gen kháng kháng sinh, Tn không có
Tn chứa gen kháng kháng sinh giữa hai IS
IS có khả năng tạo bản sao qua RNA, Tn thì không
Tn không có transposase
Cơ chế tái tổ hợp tương đồng (Homologous Recombination) thuộc nhóm cơ chế nào của DNA?
Tính ổn định
Tính biến động
Sửa sai trực tiếp
Sao chép DNA
