Là vùng bị chiếm chỗ bởi một phân tử tín hiệu khi phân tử đó liên kết với receptor

  Là một phần của phân tử thuốc mà liên kết với mục tiêu

Là các nhóm chức của phân tử thuốc liên kết với mục tiêu của thuốc

Là các dạng liên kết mà một phân tưe thuốc liên kết với mục tiêu của nó

Là tên một cơ sở dữ liệu về các phân tử hoá học và các hoạt tính của chúng đối với các thử nghiệm sinh học

Một tạp chí khoa học hàng đầu thế giới về vật lý nguyên tử.

Một phần mềm mô phỏng thời tiết và khí hậu toàn cầu.

Một công ty dược phẩm lớn chuyên sản xuất vắc-xin.

  AutoDock, DocK, FlexX

Python, Matlab

   Chemdraw, ACD/Labs

Chemdraw, Python

ii: Liên kết ion; iii: tương tác Van der Waals

ii: Liên kết Hydro; iii: Tương tác lưỡng cực

   ii: Tương tác lưỡng cực; iii: Tương tác Van der Waals

ii: Tương tác Van der Walls, iii: Liên kết hydro

Liên kết hydro

Tương tác lưỡng cực

Tương tác van der Waals

Liên kết ion

Hấp thu, Phân phối, Chuyển hóa, Thải trừ

Hấp thu, Chuyển hóa, Phân Phối, Thải trừ

Phân Phối, Hấp thu, Chuyển hóa, Thải trừ

Hấp thu, Chuyển hóa, Phân Phối, Thải trừ

Là một thuật toán về chương trình để so sánh thông tin trình tự sinh học cơ bản, như trình tự axit amin của protein hoặc trình tự nucleotide của DNA và/ hoặc RNA

Là một cơ sở dữ liệu trực tuyến toàn diện, có thể truy cập miễn phí, chứa thông tin về chất kích thích và các chất dược phẩm

Là một cơ sở dữ liệu về các phân tử hóa học và các hoạt tính của chúng đối với các thử nghiệm sinh học

Là một cơ sở dữ liệu về cấu trúc ba chiều của các đại phân tử sinh học như protein và acid nucleic

Quá trình mà một cơ chất liên kết với một vùng hoạt động và làm thay đổi hình dạng của vùng đó

Quá trình mà một vùng hoạt động thay đổi hình dạng sao cho nó sẵn sàng nhận một cơ chất

Quá trình mà một cơ chất chỉ chất nhận dạng tương tác phù hợp trước khi đi vào vùng hoạt động

Quá trình mà một vùng hoạt động làm thay đổi hình dạng của cơ chất sao cho cơ chất có hình dạng hoạt động phù hợp để liên kết

Đồng tố ( cofactor)

Đồng giả

Coenzyme

Chất điều hòa

Ligand

Bigand

Ligrand

Bigrand

{T1}, {T2}, {T3} đều đúng

T1: enzyme

 T2: kênh ion

T3: Thụ thể màng

{T1}, {T2}, {T3} đều đúng

T1: chủ yếu là tương tác Van der Waals

T2: chủ yếu là liên kết hydro

T3: chủ yếu là liên kết ion

Thuốc

Chất độc

Enzyme

Hormones

Thực vật, động vật, khoáng vật hay sinh phẩm

Thực vật, động vật, khoáng vật

Động vật, khoáng vật hay sinh phẩm

Thực vật, động vật, sinh phẩm

Absorption, Distribution, Metabolism and Excretion

Administration, Differentiation, Metabolism, and Excretion

Absorption, Disintegration, Metabolism and Eficacy

Administration, Distribution, Metabolism and Eficacy

Xác định tính hiệu quả và an toàn của các ứng cử viên thuốc tiềm năng

Điều chế các hợp chất có tiềm năng chữa bệnh thành thuốc

Gồm các thí nghiệm phi lâm sàng và thử nghiệm trên động vật

Đảm bảo không có tác dụng phụ của các loại thuốc tiềm năng

Mục tiêu thuốc ở cấp độ phân tử

Tác dụng dược lý

Tác dụng của thuốc

Cấu trúc hóa học

Nghiên cứu khả năng gắn kết giữa 2 phân tử

Nghiên cứu sự gắn kết “ chìa hóa - ổ khóa”

Nghiên cứu mức năng lượng liên kết các phân tử

Nghiên cứu thuốc dựa vào cấu trúc mục tiêu

Người bệnh để đánh giá hiệu quả của thuốc và các tác dụng phụ

Động vật

Một nhóm nhỏ người tình nguyện

Các quần thể khác nhau với số lượng người tham gia lớn

Các quần thể khác nhau với số lượng người tham gia lớn để thu thập thêm thông tin về an toàn và hiệu quả

Người bệnh đã đánh giá hiệu quả của thuốc và các tác dụng phụ

Động vật

Một nhóm nhỏ người tình nguyện

Một nhóm nhỏ người tình nguyện để đánh giá an toàn trên người và xác định khoảng liều an toàn

Người bệnh đánh giá hiệu quả của thuốc và các tác dụng phụ

Các quần thể khác nhau với số lượng người tham gia lớn, thường so sánh với một nhóm đối chứng

Động vật

{T1}và{T2} đúng

T1: thử nghiệm in vitro

T2: thử nghiệm in vivo

- T3: thử nghiệm in silico

Nghiên cứu về tác động của cơ thể đến thuốc

Nghiên cứu tác dụng phụ, tác dụng không mong muốn hay tác dụng ngoại ý

Nghiên cứu số lần dùng thuốc trong ngày, liều lượng, tác dụng phụ

Nghiên cứu tuổi, trạng thái bệnh, trạng thái sinh lý

Nghiên cứu tác động của thuốc trên cơ thể sống

Là môn khoa học nghiên cứu về thuốc

Nghiên cứu về tác động của cơ thể đến thuốc

Động học của sự hấp thu, phân phối, chuyển hóa và thải trừ

Thuốc gồm thuốc thành phẩm, nguyên liệu làm thuốc, vắc xin, sinh phẩm y tế, thực phẩm chức năng

Thuốc điều chỉnh chức năng sinh lý cho cơ thể

Thuốc nhằm mục đích phòng bệnh, chữa bệnh, chuẩn đoán bệnh

Thuốc là các chất hoặc hỗn hợp các chất dành cho người

Vitamin C

DNA

RNA

Protein

Sự bổ sung

Sự hấp thu

Sự thải trừ

Sự phân phối

Dựa vào kích thước

Dựa vào cấu trúc hóa học

Dựa vào tác dụng của thuốc

Dựa vào mục tiêu

Thụ thể

Phối tử

Enzyme

Hormone

Là cấu trúc lõi phân tử phổ biến của một loạt các hợp chất tương tự nhau

Là hợp chất dẫn ( lead compound)

Là khung chỉ chứa carbon của một hợp chất

Là dược điển

Mối quan hệ hoạt tính – cấu trúc ( SAR)

Độc tính

Chuyển hóa thuốc

Dược lý

Các đặc điểm cấu trúc quan trọng của một phân tử thuốc đối với hoạt tính sinh học của nó

Các nhóm chức năng quan trọng đối với khả năng phản ứng hóa học của thuốc

Các tính chất hóa lý quan trọng đối với sự hấp thu của thuốc vào nguồn cung cấp máu

Các đặc điểm cấu trúc của một loại thuốc quan trọng đối với độ bền hóa học của nó

LD₅₀

LD₁

ED₅₀

ED₉₉

{T1}và{T2} đúng

T1: Hấp thu, Phân bố, Chuyển hóa, Thải trừ

T2: Hấp thu, Phân bố, Chuyển hóa, Thải trừ

{T1}và{T2} sai

Quá trình hấp thu chỉ xảy ra ở đường tiêu hóa

Giai đoạn đầu tiên khi thuốc vào cơ thể là quá trình hấp thu

Hấp thu chịu ảnh hưởng của dạng bào chế

Hấp thu qua đường tiêm xảy ra nhanh hơn đường uống

Một hợp chất đóng vai trò là điểm khởi đầu cho sự thiết kế và phát triển thuốc

Một loại thuốc có chứa nguyên tố chì

Một loại thuốc hàng đầu trong một lĩnh vực cụ thể của y học

Một loại thuốc thường là thuốc đầu tiên được kê đơn cho một bệnh cụ thể

Giúp người thầy thuốc biết cách chọn đường đưa thuốc vào cơ thể

Giúp người thầy thuốc biết số lần dùng thuốc trong ngày, tác dụng phụ

Là động học của sự hấp thu, phân giải, chuyển hóa và thải trừ

Đánh giá một cách có hệ thống các phản ứng độc hại có liên quan đến việc dùng thuốc

Phân tử thuốc cần đạt được một kích cở duy nhất đủ với kích thước của thụ thể đặc hiệu để thuốc không gắn được vào các thụ thể khác

Phân tử thuốc cần đạt được một kích cỡ đủ hoặc lớn hơn với kích thước của thụ thể đặc hiệu để thuốc không gắn được vào các thụ thể khác

Phân tử thuốc cần đạt được một kích cỡ đủ hoặc nhỏ hơn với kích thước của thụ thể đặc hiệu để thuốc không gắn được vào các thụ thể khác

Thụ thể không có tính chọn lọc

Tan được trong Lipid

Tan được trong nước

Tan được trong acid

Tan được trong base

Ít bị ion hóa

Bị ion hóa nhiều

Không liên quan đến khả năng ion hóa

Tất cả các thuốc đều dễ phân tán và hấp thu

{T1}, {T2}, {T3} đều đúng

T1: có trọng lượng phân tử thấp

T2: tan được trong lipid của màng tế bào

T3: dễ tan trong dịch tiêu hóa

{T1}, {T2}, {T3} đều đúng

T1: vận chuyển thuốc bằng cách lọc

T2: vận chuyển bằng khuếch tán thụ động

T3: vận chuyển tích cực

Tan được trong nước

Tan được trong lipid

Tan được trong nước và lipid

Tan được trong tất cả các môi trường

{T1}, {T2}, {T3} đều đúng

T1: phân tử qua lọc có khối lượng phân tử thấm ( 100 – 200)

phân tử tan được trong nước nhưng không tan được vào trong lipid sẽ chui qua các ống dẫn của màng sinh học

sự chênh lệch áp lực thủy tĩnh

Từ nơi có nồng độ cao sang nơi có nồng độ thấp

Từ nơi có môi trường acid sang môi trường base

Từ nơi có môi trường base sang môi trường acid

Từ nơi có áp suất cao sang áp suất thấp

Vận chuyển thuốc bằng cách lọc

Vận chuyển bằng khuếch tán thụ động

Vận chuyển tích cực

Tất cả các hình thức vận chuyển thuốc

Vận chuyển bằng khuếch tán thụ động

Vận chuyển tích cực

Vận chuyển thuốc bằng cách lọc

Tất cả đều sai

Phương trình Hansch

Phương trình Free-Wilson

Phương trình Hammett

tất cả đều sai

{T1}, {T2}, {T3} đều đúng

T1: thải trừ qua thận

T2 : phản ứng oxi hóa

T3 : phản ứng thủy phân

Phản ứng liên hợp

Phản ứng oxy hóa

Phản ứng khử

Phản ứng thủy phân

Thêm nhóm chức phân cực vào thuốc

Thêm một phân tử phân cực vào một nhóm chức trên thuốc hoặc có trên một trong các chất chuyển hóa của nó

Xảy ra trong việc cung cấp máu

Xảy ra trong thành ruột

Gắn thêm một phân tử phân cực vào một nhóm chức trên thuốc hoặc trên một trong các chất đã bị chuyển hóa trước đó

Xảy ra trong sự cung cấp máu

Thêm nhóm chức phân cực vào thuốc

Xảy ra trong thành ruột

{T1}, {T2}, {T3} đều đúng

T1: chủ yếu là tương tác Van der Walls

T2 : chủ yếu là liên kết hydro

T3 : chủ yếu là liên kết ion

Hoạt tính sinh học của một chất

Nồng độ của một chất

Khả năng phân hủy của một chất

Khả năng phản ứng của một chất

Hằng số phân bố dầu – nước, liên kết hydro, trong lượng phân tử

Phân tử lượng, khả năng cho và nhận liên kết hydro

Phân tử lượng logP, khả năng thân dầu

Cấu dạng phân tử,liên kết Hydro

Loại bỏ trước các chất không có khả năng dùng bằng đường uống

Thiết kế thuốc hợp lý

Sàng lọc các chất có hoạt tính

Loại bỏ các thoát tan kém trong dung môi

{T1}và{T2} đúng

T1: chất vận chuyển (carrier)

T2: có thể cần ATP

T3: vận chuyển tích cực không cần chất vận chuyển hay ATP

{T1}và{T2} đúng

T1: vận chuyển thuận lợi

T2: vận chuyển tích cực thực thụ

{T1}và{T2} sai

Là một phân tử được gắn vào giá đỡ rắn và chứa một nhóm chức cho phép xảy ra sự gắn đó

Là một liên kết mà nối một phân tử với một giá chất rắn

Là một nhóm chức có hoạt tính của một giá chất rắn mà cho phép một phân tử nào đó định vào chất rắn

Là nhóm chức của chất tham gia phản ứng được sử dụng để gắn chất đó vào giá đỡ rắn

Sự thay đổi các đặc tính hóa lý của các chất hóa học

Cấu trúc hóa học

Sự thay đổi cấu trúc hóa học

Sự thay đổi giá trị cấu trúc

A

B

C

D

Thụ thể nội tiết

Thụ thể tyrosine kinase

Thụ thể kết hợp G-protein

Thụ thể nội bào

Việc giải độc thuốc, chuyển hóa tế bào và cân băng nội môi

Việc giải độc thuốc

Chuyển hóa tế bào và cân bằng nội môi

Việc giải độc thuốc và chuyển hóa tế bào

Mối quan hệ hoạt tính – cấu trúc

Dược điển

Bioassay

Bằng sáng chế

Nhằm làm tăng sự hấp thu

Giúp thuốc chuyển từ đang tan được trong lipd, không bị ion hóa, dễ thấm qua màn tế bào, dễ gắn vào protein thành dạng dễ tan hơn ở trong nước, dễ bị thải trừ ( qua thận, qua phân)

 Nếu không có các quá trình sinh chuyển hoá, một số thuốc rất dễ tan trong lipid ( như pentothal) có thể bị giữ lại trong cơ thể rất lâu

Có sự tham gia của nhiều enzyme

Không có quy tắc chung về kích thước tương đối của thuốc và mục tiêu của chúng

Thuốc và các mục tiêu của thuốc thường có trong lượng phân tử tương tự nhau

Thuốc thường nhỏ hơn mục tiêu của thuốc

Thuốc thường lớn hơn mục tiêu của thuốc

Không thể vượt qua lớp kép do phần đuôi kỵ nước của các phân tử phospholipid

Không thể vượt qua lớp kép do phần đầu của chuỗi phospholipid mang điện tích

Được hỗ trợ để vượt qua lớp kép bằng cách tương tác với các nhóm điện tích ở phần đầu của chuỗi phospholipid

Có thể đi qua màng tế bào nhờ các phân tử trong lớp kép là chất lỏng làm màng tế bào xốp

Vị trí của thụ thể trong màng

Hình dạng của vùng liên kết

Cấu trúc

Thành phần amino acid

Có sẵn trên màng tế bào

T1: Được đưa từ bên ngoài vào

T2: Chỉ xuất hiện có sự hiện diện của thuốc

{1} và {T2} sai

Một tiểu đơn vị α (alpha) và một cặp dimer β,γ (beta-gamma)

Một tiểu đơn vị γ và một cặp dimer α, β

Một tiểu đơn vị β và một cặp dimer α, γ

Các tiểu đơn vị protein là thành phần cấu tạo nên nó

Acetylcholine

Insulin

Hormone tăng trưởng (growth factors)

Cytokines

Phản ứng phosphoryl hóa các nhóm alcohol trong cơ chất protein

Phản ứng thủy phân các nhóm phosphate trong cơ chất protein

Phản ứng phosphoryl hóa các nhóm alcohol trong carbohydrate

Phản ứng thủy phân các nhóm phosphate trong ATP và GTP

Đây là một vùng liên kết, tách biệt với vùng hoạt đọng thật sự của enzyme và ảnh hưởng đến hoạt động của enzyme khi nó tương tác với một phối tử

Đây là một vùng liên kết có chứa các amini acid với chuỗi bên mạch thẳng

Đây là một vùng liên kết có thể nhân nhiều loại phân tử có hình dạng khác nhau

Đó là một mô tả của vùng hoạt đông sau khi trải qua quá trình “ khớp cảm ứng”

Chuỗi đầu N là ngoại bào và chuỗi đầu C là nội bào

Nó chứa năm tiểu đơn vị kỵ nước xuyên màng

Có nhiều vòng ngoại bào hơn vòng lặp nội bào

Vùng liên kết của Protein G liên quan đến 2 vòng ngoại bào

Vị trí liên kết phối tử nằm trong chuỗi chứa đầu N

Nó nằm trong tế bào chất

Chuỗi chứa đầu N ở nội bào

Nó có hai tiểu hơn vị nằm xuyên màng kỵ nước

Oxy hóa, khử hóa, thủy phân

Oxy hóa, thủy phân, liên hợp

Thủy phân, liên hợp

Khử hóa, thủy phân, liên hợp

Gan, tim, phổi, thận

Dạ dày, ruột, thận

Thận, tụy, thực quản

Tá tràng, thận, dạ dày

Chúng có hình dạng không đổi

Chúng là protein

Hình dạng của vị trí gắn thụ thể thay đổi để phù hợp với chất truyền tin

Chúng có mặt trong màng tế bào

LogP lớn hơn 5

Không quá 5 nhóm cho liên kết hydro

Khối lượng phân tử nhỏ hơn 500 Dalton

Không quá 10 nhóm nhận liên kết hydro

Để được hấp thu vào tế bào thuận lợi nhất thuốc cần có một tỷ lệ tan trong nước/tan trong lipid thích hợp

T1: Tan được trong lipid ( dịch tiêu hoá, dịch khe), do đó dễ được hấp thu

T2: Tan được trong nước để thấm qua được màng tế bào, gây ra được tác dụng dược lý vì màng tế bào chứa nhiều phospholipid

{T1}, {T2} đúng

Thụ thể bắt cặp với G protein

Thụ thể kênh ion

Thụ thể nội bào

Thụ thể liên kết với enzyme Kinase

Thụ thể liên kết với enzyme Kinase

Thụ thể kênh ion

Thụ thể nội bào

Thụ thể bắt cặp với G Protein

Là sự vận chuyển thuốc từ nơi dùng thuốc (uống, tiêm) vào máu

Không tính đến các đường hấp thu ngoài đường uống

Là quá trình thứ hai của dược động học

Không ảnh hưởng đến sinh khả dụng của thuốc

Đ: Một phần thuốc sẽ gắn vào protein của huyết tương, phần thuốc tự do không gắn vào protein sẽ qua thành mạch để chuyển vào các mô vào nơi tác dụng

T1: Là quá trình xảy ra đồng thời với hấp thu

{Đ} và { T1} đúng

{Đ} và { T1} sai

Các thuốc có cùng hoạt chất có thể thay thế lẫn nhau

Không có thuốc nào vô hoại

Không phải thuốc đắt tiền luôn luôn là thuốc tốt nhất

Chỉ dùng khi thật cần, hết sức tránh lạm dụng thuốc

Tối đa hóa sinh khả dụng đường uống

Giảm tác dụng phụ

Giảm độc tính

Tối đa hóa hoạt tính

{T1}, {T2}, {T3} đều đúng

T1: đường thẳng là biểu diễn liên kết giữa các nguyên tử

T2 : quả bóng và cây gây biểu diễn các nguyên tử và liên kết

T3 : Biểu đồ ruy băng để biểu thị các đường xoắn ốc α và các sợi β của protein

Độ ổn định của thuốc

Độ hòa tan của thuốc

pH tại chỗ hấp thu

Diện tích vùng hấp thu

{T1}, {T2}, {T3} đều đúng

T1: bị enzyme tiêu hóa phá hủy

T2 : tạo phức hợp với thức ăn

T3 : kích thích niêm mạc gây loét

Thụ thể nội bào

Thụ thể liên kết với enzyme Kinase

Thụ thể kênh ion phụ thuộc phối tử

Thụ thể bắt cặp protein G

A: Hormone tăng trưởng (GH), B: Enzyme Kinase

A: Yếu tố tăng trưởng biểu bì( EGF), B: enzyme Kinase

A: Insulun, B: Enzyme Kinase

A: Hormone tăng trưởng (GH), B: Protein G

C:ATP; D: ADP; E: Quá trình Phosphoryl hóa

C: ADP; D: ATP; E: Quá trình Dimer hóa

C: ATP; D: ADP; E: Quá trình Hydroxyl hóa

C: ATP; D: ADP; E: Quá trình hoạt hóa enzyme Kinase

A: Vùng liên kết với phối tử; E: -COOH; C: màng tế bào

A: -COOH; E: NH2; C: tiểu đơn vị protein xuyên màng

A: -COOH; E: NH2; C: màng tế bào

A: -NH₂; E: -COOH; C: màng tế bào

B: -NH₂; D: -COOH

B: Vùng liên kết với phối tử, D: Vùng liên kết với protein G

B: Nhóm -COOH; D: Vùng liên kết enzyme Kinase

B: Vùng liên kết với phối tử; D: Vùng liên kết với enzyme Kinase

Vì nó có cấu trúc steroid, một dạng lipid tan trong dầum có thể di chuyển qua lớp kép phospholipid của màng tế bào

Vì nó là phân tử phân cực, ái nước, có thể di chuyển qua lớp phospholipid của màng tế bào

Thụ thể kênh ion mở cho nó đi qua

Vì nó được một protein vận chuyển xuyên màng

Cả QSAR 3D hoặc QSAR truyền thống đều chỉ dùng để nghiên cứu các thuốc có cùng nhóm cấu trúc

QSAR 3D có chất lượng dự đoán không giống như QSAR

Kết quả có thể được hiển thị bằng đồ họa trong QSAR 3D, nhưng không thể với QSAR thông thường

QSAR 3D không yêu cầu các thông số thí nghiệm như QSAR truyền thông

{T1}, {T2}, {T3}, đều đúng

T1: Giúp thiết kế những phân tử thuốc mới với những ứu thế vượt trội, giải thích bản chất phân tử của các tương tác thuốc

T2: Dựa đoán hoạt tính sinh học sử dụng các mô hình toán học, nghiên cứu dự đoán cơ chế tác dụng, cơ chế gây độc của các hợp chất

T3: Hợp chất được nghiên cứu không nhất thiết phải có sẵn, dùng mô phỏng ảo trên máy tính để thử nghiệm

Thay đổi pH của môi trường dịch cơ thể

Thay đổi độ nhớt của môi trường dịch cơ thể

Thay đổi pKa của thuốc

Thay đổi vị trí tác dụng của thuốc

Sự khác biệt về điện thế màng ảnh hưởng việc thụ thể kênh ion phụ thuộc phối tử mở hay đóng

Các thụ thể kênh ion phụ thuộc phối tử có trên màng tế bào

Các chất dẫn truyền thần kinh có thể đóng vai trò là tín hiệu hóa học, cho các kênh ion phụ thuộc phối tử

Các kênh ion phụ thuộc phối tử bao gồm năm glycoprotein